Benoît XVI estime que l'Eglise catholique traverse une "période difficile" et que les prêtres doivent en faire plus pour que les populations latino-américaines ne s'en détournent pas. Présentant le Brésil comme un pays très affecté par la pauvreté, dans lequel de nombreux hommes politiques ne se préoccupent que d'eux-mêmes, il a déclaré aux évêques brésiliens qu'ils devaient se consacrer aux plus démunis. Il a brossé cet état des lieux plutôt sévère au troisième jour de sa visite pastorale dans le pays catholique le plus peuplé du monde.
"L'époque actuelle est une période très difficile pour l'Eglise", a déclaré Benoît XVI à environ 250 évêques. Après avoir dirigé une messe festive pour la canonisation d'un moine franciscain, premier saint du Brésil, Benoît XVI a dénoncé une nouvelle fois le relâchement de la morale, la promiscuité sexuelle et l'avortement. Il a également abordé un autre sujet de préoccupation pour le Vatican, l'éloignement de millions de personnes du giron de l'Eglise catholique. Il a estimé que les groupes protestants bénéficiant de la désaffection de nombreux fidèles vis-à-vis de l'Eglise catholique pratiquaient un prosélytisme agressif et souligné que beaucoup se détournaient totalement de la religion. "Aucun effort ne doit être épargné pour rechercher ces catholiques qui se sont éloignés", a-t-il dit. D'après Benoît XVI, les millions de pauvres vivant en périphérie des villes ou dans les campagnes doivent sentir que l'Eglise les aide à satisfaire leurs besoins et à défendre leurs droits. Sous les applaudissements de son auditoire, il a déploré les maux de la société brésilienne, tels que les écarts de revenus, et a implicitement condamné la corruption. "Il faut instaurer un authentique esprit d'honnêteté parmi les classes politiques et commerçantes". La politique brésilienne a souvent été entachée par des affaires de corruption. Le premier mandat du président Luiz Inacio Lula da Silva, issu d'un milieu modeste et apprécié de la classe ouvrière, a été lui aussi touché par une série d'affaires. Les propos du pape devraient plaire aux prêtres travaillant dans les favelas, qui voyaient auparavant en lui un conservateur concentré sur l'application stricte de la doctrine de l'Eglise. "C'était un discours de soutien, un message de courage, avec des instructions claires pour les évêques", a déclaré le professeur de théologie Fernando Altemeyer, de l'Université catholique Pontificia. Auparavant, le pape avait animé une messe devant près d'un million de personnes, sur un terrain d'aviation, pour la canonisation de Frère Antonio Galvao, moine franciscain ayant vécu au 18e siècle. La canonisation du premier saint né au Brésil était un geste important dans le cadre de la mission papale de promotion du catholicisme en Amérique latine, où habitent près de la moitié des catholiques du monde.